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Immuno_notes:免疫学相关的生物信息学数据和工具
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2021-05-11
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免疫学相关工具和数据库的注意事项 主要与癌症有关。 请! 有关其他编程和与基因组相关的说明,请参见说明。 表中的内容 去卷积 审查并确定7种免疫反卷积工具的基准。 表1-解卷积方法概述,表2-不同免疫细胞类型的建议。 使用已知比例和单细胞类型的基因表达的混合,进行平均表达。 在实现了对方法的访问。 Sturm,Gregor,Francesca Finotello,Florent Petitprez,Jitao David Zhang,Jan Baumbach,Wolf H Fridman,Markus List和Tatsiana Aneichyk。 “免疫肿瘤学计算细胞类型定量方法的综合评估。” BioRxiv,1月27日,2019年 。 xCell-大量基因表达解卷积为64种免疫和基质细胞类型。 细胞签名(6573个基因)是从1822个纯人类细胞类型的转录组(六个来源)生成的。 单
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TIMER
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IRIS.txt 570KB
ImmGen.txt 9.03MB
DMAP.txt 701KB
quanTIseq
223180-4.xlsx 39KB
BRCA
221994-4.xlsx 46KB
221994-2.xlsx 39KB
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EINAV_INTERFERON_SIGNATURE_IN_CANCER.txt 157B
IRIS.xlsx 811KB
29_signatures.xlsx 417KB
Cibersoft
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