没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
mutation-rate-ci-calculator:该软件根据简单的核苷酸突变过程中的一组观察到的遏制指数计算突变率的置信区...
共5个文件
py:3个
txt:1个
md:1个
需积分: 10 0 下载量 103 浏览量
2021-04-08
05:04:00
上传
评论
收藏 15KB ZIP 举报
温馨提示
突变率间隔 该软件根据简单的核苷酸突变过程中的一组观察到的遏制指数,计算出突变率的置信区间。 在该模型中,序列B是通过以概率p独立突变每个核苷酸而从序列A演变而来的。 然后,我们观察到由于突变过程而导致的按比例缩放的围堵指数。 然后,软件为突变率p生成置信区间。 快速开始 要从观察到的比例化围堵指数中计算出置信区间: $ p-from-scaled-containment.py L=100K k=21 C=0.95 Cks=0.10605 L k conf Cks CLow CHigh pLow pHigh 100000 21 0.95 0.10605 0.10046 0.11191 0.09623 0.10655 输出 在上面的示例中, L , k , conf和Cks值分别是k-mer的输入数量,k-mer大小,
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
mutation-rate-ci-calculator-master.zip (5个子文件)
mutation-rate-ci-calculator-master
requirements.txt 12B
p-from-scaled-containment.py 6KB
hypergeometric_slicer.py 22KB
README.md 4KB
kmer_mutation_formulas_thm5.py 13KB
共 5 条
- 1
资源评论
司幽幽
- 粉丝: 30
- 资源: 4547
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功