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山羊:Python库,用于处理基因本体论(GO)术语
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基因本体论工具 作者 海宝堂( ) DV( ) 布伦特·佩德森() 菲德尔·拉米雷斯( ) Aurelien Naldi( ) 帕特里克·弗里克( ) 杰夫·尤恩斯( ) 佐藤健太( ) 克里斯·蒙加(Chris ) 格雷格·( ) 戴维·德托马索( ) 奥尔加·( ) 电子邮件 执照 BSD 描述 该软件包包含一个Python库,用于 根据Fisher的精确测试,处理某些GO术语的过高和不足表示。 具有多种多样的校正例程,包括Bonferroni,Sidak,Holm和错误发现率的本地实现例程。 此外,还包括从多个测试校正 :FDR的Benjamini / Hochberg的,FDR的Benjamini / Yekutieli,霍尔姆-Sidak,西门斯-Hochberg指出霍梅尔,FDR 2级的Benjamini-Hochberg的,F
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山羊:Python库,用于处理基因本体论(GO)术语 (499个子文件)
fig1a.anno 3KB
fig2a.anno 1KB
fig1b.anno 1KB
fig1a_small.anno 195B
fig2a_small_b.anno 143B
fig2a_small.anno 130B
fig2a_nonleaf0.anno 119B
faa2a_nonleaf0.anno 102B
association 2.42MB
setup.cfg 134B
fig1a.gaf 18KB
goa_human_illegal.gaf 14KB
fig2a.gaf 9KB
fig1b.gaf 8KB
fig1a_small.gaf 1KB
fig2a_small_b.gaf 1019B
fig2a_small.gaf 928B
fig2a_nonleaf0.gaf 711B
faa2a_nonleaf0.gaf 612B
.gitattributes 34B
.gitignore 218B
.gitignore 83B
.gitignore 67B
.gitignore 15B
.gitignore 6B
.gitignore 6B
MANIFEST.in 155B
cell_cycle.ipynb 113KB
get_isa_and_partof.ipynb 22KB
goea_nbt3102_group_results.ipynb 20KB
goea_nbt3102.ipynb 18KB
dcnt_and_tinfo.ipynb 15KB
semantic_similarity_wang.ipynb 11KB
goea_nbt3102_all_study_genes.ipynb 11KB
relatonships_in_the_go.ipynb 11KB
relationships_change_dcnt_values.ipynb 9KB
parent_go_terms.ipynb 8KB
semantic_similarity.ipynb 7KB
annotations_gaf_file.ipynb 7KB
annotations_ncbi_gene2go.ipynb 7KB
annotation_coverage.ipynb 7KB
parents_and_ancestors.ipynb 6KB
report_depth_level.ipynb 6KB
godag_obsolete_terms.ipynb 5KB
goea_nbt3102_fncs.ipynb 4KB
backround_genes_ncbi.ipynb 2KB
LICENSE 1KB
makefile 15KB
Makefile 7KB
makefile 2KB
makefile 357B
makefile 149B
makefile 127B
README.md 15KB
README_find_enrichment.md 12KB
CHANGELOG.md 10KB
README_go_plot.md 5KB
README_wr_hier.md 3KB
README_NCBI_gene.md 2KB
README.md 2KB
README.md 2KB
README_heartjogging.md 1KB
README_secretory.md 1KB
README_smell.md 1KB
README.md 957B
README.md 555B
README.md 492B
README.md 474B
README.md 308B
gaf_missingsym.mgi 4KB
yang.mk 457B
goslim_generic.obo 246KB
viral_gene_silence.obo 35KB
heartjogging.obo 21KB
i86.obo 18KB
secretory.obo 16KB
smell.obo 11KB
mini_obo.obo 2KB
fig1a.obo 1KB
fig1b.obo 1KB
fig1.obo 954B
fig2a.obo 747B
faa2a.obo 646B
mini_slim_obo.obo 498B
nbt3102_CC.png 1.72MB
viral_r1.png 813KB
viral_r1.png 809KB
viral_gene_silence_r1.png 751KB
viral_r_regrn.png 483KB
viral_r_regrpn.png 478KB
viral_rn.png 477KB
viral_r_regrp.png 458KB
viral_r_partof.png 456KB
viral_r_partof.png 452KB
viral_reg.png 450KB
heartjogging6_r1.png 428KB
heartjogging_r1.png 422KB
heart_jogging_ice_r1.png 397KB
heart_jogging_r1.png 396KB
GO_0003304_myocardial_epithelial_involution_involved_in_heart_jogging_r1.png 391KB
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