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PLB2020:2020-21年生物信息学编程实验室课程的材料
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2021-03-29
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2020年PLB 2020-21年生物信息学编程实验室课程的材料 该存储库包含: 滑梯 演习 消息 !!! 讲座将于3月26日(星期五)开始! !!! 4月1日(星期四)上午9点至12点(CET)将有一个额外的演讲!!! 课程内容 以下内容可在“ lectures_materials_and_slides目录中找到: 课程介绍,Github和R markdown语言介绍 R编程基础 Unix Bash编程 生物导体概论 练习题 该作业是在可用的exercises目录: R编程基础-两组练习(在exercises/R_basics ) Unix Bash编程-包含有关bash练习的jupyter笔记本(在exercises/Bash ) 生物导体-三套练习(在exercises/Bioconductor )
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PLB2020-main.zip (30个子文件)
PLB2020-main
support
NGSsw
README.md 4KB
install_tools_linux.sh 2KB
install_tools_mac.sh 2KB
LICENSE 1KB
exercises
R_basics
Rbasics_Q&A_test.Rmd 5KB
Exercises48-78.R 8KB
exercises 1-47.R 21KB
Bioconductor
exercises_ANNOTATION.R 3KB
Bioconductor_Q&A_test
data
pathway_scoring.tsv 44KB
input_gene.csv 2KB
airway_new.RDS 1.27MB
coldata.rds 417B
Bioconductor_Q&A_test2.Rmd 4KB
Bioconductor_Q&A_test3.Rmd 5KB
Bioconductor_Q&A_test.Rmd 5KB
GSE87495_counts.csv 1.16MB
exercises.R 5KB
EXERCISE_Bioconductor.R 6KB
Bash
data
families.fa 12.79MB
GCF_000027325.1_ASM2732v1_genomic.gff 243KB
Bash_Q&A_test
Bash_Q&A_test.Rmd 3KB
my_dataset.tsv 319B
grafimo_out.gff 165KB
Bash_exercise.ipynb 5KB
README.md 877B
lectures_materials_and_slides
05-ngs_data_analysis.zip 6.71MB
03-bash_programming.zip 469KB
04-bioconductor.zip 8.64MB
01-introduction.zip 1.44MB
02-R_programming.zip 15KB
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泰国旅行
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