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qtl2:用于高维数据和复杂交叉设计的QTL分析软件
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2021-05-07
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(又名qtl2)是QTL分析软件的重新实现,可以更好地处理高维数据和复杂的交叉设计。 另请参阅相关的软件包 ,用于在R / qtl2, 和格式之间转换数据。 安装 从安装R / qtl2: install.packages("qtl2") 小插图 (另请参见和qtl2data存储库) 准备R / qtl2的DO鼠标数据 R / qtl和R / qtl2之间的差异 开发者指南 HMM基准 引文 要在出版物中引用R / qtl2,请使用: Broman KW,Gatti DM,Simecek P,Furlotte NA,Prins P,SenŚ,Yandell BS,Churchill GA(2018)R / qtl2:用于绘制具有高维数据和多父母群体的数量性状基因座的软件。 遗传学211:495-502 doi:10.1534 / genetics.118.301595 执照 根
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qtl2:用于高维数据和复杂交叉设计的QTL分析软件 (620个子文件)
CITATION 1KB
RcppExports.cpp 153KB
hmm_estmap2.cpp 24KB
cross_do_util.cpp 23KB
cross_ail.cpp 19KB
cross_ailpk.cpp 19KB
linreg_eigen.cpp 17KB
cross_ail3.cpp 17KB
cross_genail.cpp 16KB
scan1_binary.cpp 14KB
cross_ail3pk.cpp 14KB
scan1_hk.cpp 14KB
cross_hs.cpp 13KB
cross_f2.cpp 13KB
cross_do.cpp 13KB
scan1coef_pg.cpp 12KB
cross_f2pk.cpp 12KB
snpprobs.cpp 12KB
cross_dopk.cpp 12KB
cross_hspk.cpp 12KB
cross_dof1.cpp 11KB
lmm.cpp 11KB
scan1coef_binary.cpp 11KB
cross_risib8.cpp 11KB
cross_riself16.cpp 10KB
matrix.cpp 10KB
binreg_weighted_eigen.cpp 10KB
cross_riself8.cpp 10KB
scan1coef_hk.cpp 10KB
scan1_pg.cpp 9KB
cross_risib4.cpp 9KB
binreg_eigen.cpp 9KB
find_peaks.cpp 9KB
cross_genril.cpp 9KB
hmm_estmap.cpp 8KB
cross_dh6.cpp 7KB
guess_phase.cpp 7KB
cross_riself4.cpp 7KB
random.cpp 6KB
cross_magic19.cpp 6KB
hmm_viterbi.cpp 6KB
hmm_viterbi2.cpp 6KB
cross_util.cpp 6KB
bayes_int.cpp 5KB
lod_int.cpp 5KB
cross_risib.cpp 5KB
brent_fmin.cpp 5KB
test_hmm.cpp 5KB
hmm_simgeno.cpp 5KB
hmm_simgeno2.cpp 5KB
fit1_pg.cpp 5KB
cross_bc.cpp 5KB
hmm_calcerrorlod.cpp 5KB
hmm_calcgenoprob2.cpp 4KB
hmm_forwback.cpp 4KB
fit1_binary.cpp 4KB
hmm_calcgenoprob.cpp 4KB
scan1blup.cpp 4KB
fit1_hk.cpp 3KB
find_ibd_segments.cpp 3KB
reduce_markers.cpp 3KB
cross.cpp 3KB
interp_genoprob.cpp 3KB
hmm_forwback2.cpp 3KB
interpolate_maps.cpp 3KB
chisq_colpairs.cpp 3KB
check_cross.cpp 3KB
clean_genoprob.cpp 2KB
linreg.cpp 2KB
binreg_weighted.cpp 2KB
count_xo.cpp 2KB
genoprob_to_alleleprob.cpp 2KB
maxmarg.cpp 2KB
binreg.cpp 2KB
predict_snpgeno.cpp 2KB
locate_xo.cpp 1KB
calc_kinship.cpp 1KB
cross_riself.cpp 1KB
compare_geno.cpp 1KB
arrange_genes.cpp 1KB
debug_util.cpp 1KB
geno_names.cpp 667B
cross_haploid.cpp 570B
r_message.cpp 568B
hmm_util.cpp 560B
get_x_covar.cpp 452B
DESCRIPTION 1KB
.gitignore 69B
.gitignore 20B
.gitignore 7B
cross.h 12KB
cross_do_util.h 8KB
scan1_binary.h 8KB
scan1_hk.h 7KB
lmm.h 5KB
hmm_estmap2.h 5KB
scan1coef_binary.h 4KB
scan1coef_pg.h 4KB
find_peaks.h 4KB
linreg_eigen.h 4KB
共 620 条
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向朝卿
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