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DGE_workshop_salmon_online
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2021-05-11
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利用鲑鱼计数的差异基因表达研讨会 观众 所需的计算能力 期间 生物学家 4节在线研讨会(约8个小时由讲师指导) 描述 该存储库提供了动手学习差异基因表达(DGE)分析研讨会的教材。 该研讨会将带领参与者通过使用R / RStudio对RNA-seq计数数据执行差异基因表达分析工作流程。 需要R的工作知识或完成。 培训师注意事项:请注意,以下链接的时间表假定学习者将花费3-4个小时在阅读和完成各节课之间所选课程的练习上。 讲习班的在线部分着重于更多练习和讨论/问答。 学习目标 使用主成分分析(PCA)和分层聚类对计数数据进行质量控制 使用DESeq2获得明显不同基因的列表 可视化差异表达基因的表达模式 使用基于R的工具对基因列表进行功能分析 经验教训 安装要求 为您的笔记本电脑下载R和RStudio的最新版本: (3.6.0或更高版本) 注意:安装以下软件包时,如果要求您选择(a /
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DGE_workshop_salmon_online (186个子文件)
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Intro_to_workshop_dfhcc.pdf 9.53MB
Intro_to_workshop_all.pdf 9.26MB
Workshop_wrapup_dfhcc.pdf 655KB
Workshop_wrapup.pdf 601KB
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易三叨
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