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biology:生物学相关模型
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2021-05-19
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生物活检 BioPSy是一种工具,可以对使用系统生物学标记语言(SBML)和相应的时间序列数据指定的生物学模型进行参数集综合。 BioPSy利用SMT求解器来确定给定域内可接受参数值的范围。 使用BioPSy计算的参数集的模型在形式上和数值上都得到保证,可以满足所需的行为。 下载 可以从下载BioPSy的最新版本,包括所有必需的二进制文件。 BioPSy是Java应用程序,需要才能运行。 是稳定的版本,它引入了一些功能并修复了许多错误。
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biology-master.zip (57个子文件)
biology-master
COPYING 18KB
README.md 1KB
LICENSE 34KB
models
CMSB2015
human_starvation
starvation.xml 12KB
starvation_time_series_data.csv 745B
Brusselator
Brusselator.csv 4KB
Brusselator.xml 6KB
BIOMD0000000006
BIOMD0000000006_time_series_data.csv 406B
BIOMD0000000006.xml 15KB
prostate_cancer_treatment
patient26_cycle4_off.csv 105B
patient26_cycle2_on.csv 54B
prostate_time_series_data.csv 127B
patient26_cycle5_on.csv 52B
patient26_cycle1_on.csv 63B
prostate_off_therapy.xml 15KB
patient26_cycle3_off.csv 105B
patient26_cycle3_on.csv 65B
patient26_cycle4_on.csv 73B
patient26_cycle2_off.csv 80B
prostate_on_therapy.xml 15KB
patient26_cycle1_off.csv 82B
BIOMD0000000010
BIOMD0000000010.csv 180B
BIOMD0000000010.xml 28KB
README.md 31B
AUTHORS 164B
BioPSy
.gitignore 76B
.project 382B
.settings
org.eclipse.jdt.core.prefs 670B
jsbml.log 248KB
src
main
BioPSy.java 2KB
parser
SMT2SettingsParser.java 12KB
TraceParser.java 2KB
OutputParser.java 5KB
ModelSettingsParser.java 3KB
model
AdvancedOptionsModel.java 2KB
TimeSeriesModel.java 389B
ODEModel.java 13KB
gui
TimeSeriesPanel.java 5KB
PlotArea.java 7KB
AdvancedOptionsDialog.java 6KB
Gui.java 33KB
util
BoxTable.java 1KB
Box.java 3KB
LogTable.java 559B
Trace.java 4KB
BackgroundWorker.java 2KB
Utility.java 21KB
ModelSettings.java 1KB
SMT2Settings.java 3KB
Interval.java 2KB
.classpath 548B
doc
install.md 735B
usage.md 6KB
.ant-targets-build.xml 70B
lib
jsbml-1.0-b1-with-dependencies.jar 3.57MB
build.xml 4KB
logs
myeasylog.log 0B
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