MilkDNA:用于共享数据和分析论文提交的回购

牛奶DNA 分析和数据支持： -审查中 以下脚本如下所述。 每个输入和输出数据集都在相应的* .Rmd文件中指示。 最终输出可以在相应HTML文件中找到。 如有疑问或其他信息，请联系： 食用动物微生物学DVM博士助理教授Erika Ganda 宾夕法尼亚州立大学psu dot edu的ganda 下图提供了研究概述： 研究概述。 每个面板描绘了评估的每个方面的设计，以及相应的生物学和技术重复次数。 对于每个实验重复，一式两份地进行qPCR测定。 计算（A）中牛，Total 16S，芽孢杆菌，李斯特菌，分枝杆菌和沙门氏菌的拷贝数； （C）中的牛，Total 16S，李斯特菌和沙门氏菌，并且在（B）和（D）中仅计算牛和Total 16S，因为未进行接种。 A.DNAResults.Rmd 概述： 该脚本将使用各种方法数据在DNA提取中加载qPCR结果，使用模型比较方法之间的估计边际平