sproutogram:一种用于提取和分析体外血管芽及其相关特性的医学成像工具，包括芽数、分支因子、平均芽长和平均芽宽
需积分: 5 182 浏览量
2021-06-15
23:28:31
上传
评论
收藏 6.08MB ZIP 举报
sproutogram-master.zip （99个子文件） 
sproutogram-master sproutogram 
report_generation.py 4KB morphology.py 1KB geometry.py 253B services analysis_strategy.py 8KB analysis_strategy analysis_strategy.py 3KB integration_strategy.py 3KB piecewise_constant_approximation.py 2KB __init__.py 100B naive_strategy.py 859B lis_strategy.py 474B piecewise_strategy.py 1KB sholl_analysis.py 3KB __init__.py 111B extraction.py 8KB params.cfg 356B set_forest.py 729B repositories base.py 85B sprout_maximum_data.csv 7KB branching_data.csv 6KB train_data.py 2KB extractions.db 229KB __init__.py 345B overview.csv 5KB trocs.csv 2KB sprout_data.csv 7KB analysis.py 1KB experiment.py 431B features.py 3KB steerable_filter.py 2KB utils.py 1KB __init__.py 176B experiments extractor.py 6KB naive_analysis.py 1KB model_analysis.py 22B __init__.py 0B noise_analysis.py 2KB sprout_segmentation.py 4KB .gitignore 234B README.md 291B bin build.sh 416B analysis steven_nan steven_nan_update.ipynb 96KB
steven_nan_update.pdf 301KB no_sprouts_found no_sprouts_found.pdf 227KB no_sprouts_found.ipynb 50KB threshold_adaptive 
20k 3 Day 7.jpg 194KB 1k 2 Day 7.jpg 185KB 20k 5 Day 7.jpg 202KB Ang1 100ng_ml 3 Day 7.jpg 195KB Control 4 Day 7.jpg 219KB 10k 1 Day 7.jpg 205KB Ang1 100ng_ml 5 Day 7.jpg 222KB Control 5 Day 7.jpg 187KB 10k 5 Day 7.jpg 221KB 1k 3 Day 7.jpg 245KB Ang1 250 ng_ml 1 Day 7.jpg 209KB 20k 2 Day 7.jpg 255KB Control 2 Day 7.jpg 216KB Control 1 Day 7.jpg 245KB 20k 1 Day 7.jpg 259KB DataSet2,3.ods 95KB
DataSet2,3.xlsx 15KB driver.py 2KB
requirements.txt 46B doc presentation architecture.tex 733B classes.tex 454B slides.pdf 494KB
sholl.png 26KB slides.snm 0B images mono_skeletonized.jpg 55KB mono_found_circle.jpg 98KB mono_dilated.jpg 57KB mono.jpg 116KB mono_preprocessed.jpg 93KB eightwaysymmetry.tex 962B slides.toc 40B ideal_bead.tex 867B slides.nav 2KB slides.tex 13KB prelim.bib 3KB slides.out 0B paper prelim.tex 31KB prelim.pdf 490KB architecture.tex 733B classes.tex 443B images mono_skeletonized.jpg 55KB mono_found_circle.jpg 98KB mono_dilated.jpg 57KB bak mono_skeletonized.jpg 89KB mono_found_circle.jpg 147KB mono_dilated.jpg 103KB mono.jpg 290KB mono_preprocessed.jpg 143KB mono.jpg 116KB mono_preprocessed.jpg 93KB eightwaysymmetry.tex 958B ideal_bead.tex 867B prelim.bib 4KB data samples three_beads.jpg 330KB mono.jpg 290KB
评论0
最新资源