hmp-oral-microbiota:我们用于口腔微生物群寡聚分析的一些数据文件和脚本

自述文件 我们最近发表了一项研究，其中我们分析了HMP项目生成的人类口腔微生物组数据。 该文件可在线获得： 该存储库包含两个R脚本和一些数据文件，我们在本文中使用这些文件来生成结果： bundance.R：此脚本标识人类口腔中寡核苷酸型的位点偏好，并报告其重要性。 请阅读稿件中“”下的“计算站点首选项”部分。 ：我们使用这些函数来生成手稿中的图2、3、4和5。 如果只运行它，脚本将生成三个示例图。 v1v3和v3v5目录包含这些脚本之一使用的数据文件。 如有任何疑问，请随时与联系。