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model-balancing:Matlab和python代码进行模型平衡
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2021-04-05
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模型平衡 是一种确定给定动力学代谢模型合理的动力学常数和代谢状态的计算方法。 为此,它使用所有这些变量的先验分布来积分通量,代谢物,蛋白质和动力学常数数据,并计算联合后验模式。 模型平衡可以在matlab或python中运行。 数据表可以格式提供,模型可以或格式提供。 Matlab:要在matlab中运行模型平衡,请查看matlab / demo中的演示脚本并将其调整为您的模型和数据。 有关Matlab的帮助,请参见“帮助模型平衡”。 有关matlab代码HTML文档,请参见matlab / doc。 Python:要在python中运行模型平衡,您的模型和输入数据需要以json文件格式进行编码。 要将模型和数据文件(SBML / SBtab格式)转换为此json文件格式,可以使用matlab函数(请参见演示脚本matlab / demo / demo_cmb_experimental
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toy_example.ipynb 8KB
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苏鲁定
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