olego:OLego –短或长RNA-seq读图，可发现外显子连接-开源

OLego是专门为从头剪接mRNA-seq读图而设计的程序。 OLego采用播种和扩展方案，并且不依赖于单独的外部映射器。 通过使用很小的种子（12-14 nt），使用Burrows-Wheeler变换（BWT）和FM-index进行有效映射，可以实现高灵敏度的接合点检测。 这也使得它对于发现小外显子特别敏感。 它在C ++中实现，并完全支持多线程，以允许快速处理大规模数据。