CCH:一种识别共享祖先基因组区域的遗传学工具-开源

Combinatorial Conflicting Homozygosity (CCH) 使用密集的单核苷酸多态性 (SNP) 基因型来识别从一组的任何或所有子集中的共同祖先继承的基因组区域。 分析速度快，可以识别包含显性性状基因的位点。 CCH对表型的存在具有鲁棒性，并且可以检测未公开的共同祖先。 有关 CCH 的相关出版物可在此处访问：http://www.biomedcentral.com/1471-2164/16/163 如果您使用 CCH，请引用：Levine AP、Connor TM、Oygar DD、Neild GH、Segal AW、Maxwell PH，大风 DP。 组合冲突纯合性 (CCH) 分析能够在存在多个表型的情况下快速识别共享基因组区域。 BMC基因组学。 2015 年 12 月；16(1):1360。 doi：10.1186/s12864-015-1360-4。 电子版 2015 年 3 月 10 日。