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fsdl_e2e_cancer_subtypes:FSDL课程的项目,以构建用于癌症亚型聚类和预测的网络应用程序
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2021-04-02
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FSLS 2021项目-脑肿瘤亚型的E2E分类 这是2021年“全栈深度学习”课程的一个项目,主要目标是构建一个端到端Webapp来对脑肿瘤样本进行聚类和分类。 该项目采用了一种学术方法来分析和分类样本,并为最终用户提供一个界面来研究亚型并将其与样本进行比较。 结果 该项目的最终结果是一个Webapp,用户可以在其中上传其转录组数据,并将其样本分类为先前发现的子类型之一。 此外,还将提供有关与其他子类型的距离的信息以及有关它们的一般信息。 方法 该项目分为2个主要部分: 脑肿瘤样本聚类 可从公共资源库免费获得转录组数据 使用自动编码器架构执行样本聚类 查找集群的主要属性 Webapp用于上载和分析样品 实施Webapp探索发现的集群 添加上传和分类功能 数据类型和来源 在开始时,仅转录组数据(RNAseq),如果可能的话,添加其他类型的数据,例如microRNA,临床数据和
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笨猫猪
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