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mba:MinION 基础分析
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2021-06-21
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mba 包可用于分析 HDF5 容器格式的基本调用文件。 它专为 Oxford Nanopore Reads 量身定制。 ###Requirements git python 2.7 pip/virtualenv(见下文) ###安装 要安装代码,请运行: git clone git://github.com/mitenjain/mba.git cd mba git pull git submodule update --init make 这将构建代码。 ###Creating一个虚拟环境来处理python依赖 mba 使用 PyPore 和 yahmm 包,它们各自需要许多 python 包。 如果存在这些依赖项,则可以使用系统 python。 否则,可以通过在 mba 基目录中运行以下命令来创建虚拟环境: virtualenv --no-site-packages --
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mba-master.zip (4个子文件)
mba-master
.gitmodules 100B
submodules
PyPore
requirements.txt 28B
README.md 944B
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RosieLau
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