echinoid_body_size_2021:与Mongiardino Koch（2021）Evolution相关的文件和代码...

echinoid_body_size_2021 介绍 数据文件和代码的存储库，这些数据和代码与类固醇（海胆，心胆和沙钱）的体型的宏观进化分析相关。该研究发表于：Mongiardino Koch（2021）。深入研究适应性景观：使用类chin体大小的案例研究。进化，出版中。 描述 该存储库中的主要文件是bodysize_analyses.R ，可用于复制模型拟合的所有阶段，输出一些摘要统计信息和图表。这包括将多种统一的宏观演化模型与捕获跨自适应景观的演化动力学的多峰Ornstein-Uhlenbeck过程进行比较。该代码还直接使用了算法（针对本研究开发），发现该算法优于其他方法来限制自适应状态转移的数量和位置，而无需事先指定。 此处存放的其他文件包括： echinoid_tree.tre ：Mongiardino Koch＆Thompson（2020）的总证据日期分析显示的最大进化枝可信度