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nscancor:用于非负和稀疏CCA的R包
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2021-05-17
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扫描仪 用于非负和稀疏规范相关分析(CCA)的R包。 CCA是一种用于查找配对数据集之间关联的方法。 例如,一项健康研究可能会记录患者队列的基因表达水平和许多生理参数。 如果人们推测生理症状的原因具有遗传成分,则可以期望在某些基因的表达与某些症状的强度之间找到关联。 CCA找到一对线性投影(称为规范向量),每个数据模态对应一个线性投影,以使投影值(称为规范变量)具有最大的相关性。 通过再次最大化它们的相关性,在它们必须与所有先前变量不相关的附加约束下找到下对规范变量。 CCA由Hotelling于1936年首次提出,与主成分分析(PCA)有很多相似之处。 如果从单个数据集的协方差矩阵的特征值分解(EVD)计算PCA解,则从两个数据集的互协方差矩阵的EVD计算CCA解。 这种方法非常有效,但是在分析过程中有时会遇到以下问题。 首先,如果至少一个数据集包含比样本更多的特征(基因表达数据的常
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nscancor-master
.gitignore 19B
NAMESPACE 172B
R
normv.R 687B
mcancor.R 10KB
macor.R 4KB
cardinality.R 970B
nscancor-package.R 698B
acor.R 5KB
nscancor.R 12KB
.Rbuildignore 19B
man
nscancor.Rd 8KB
acor.Rd 3KB
macor.Rd 2KB
mcancor.Rd 6KB
cardinality.Rd 414B
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tests
run-all.R 751B
testthat
test_nscancor.R 3KB
test_mcancor.R 3KB
test_acor.R 2KB
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inst
atexample
mcancor_examples.R 988B
nscancor_examples.R 2KB
CITATION 436B
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阿礅
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