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seurat-disk:基于HDF5的单单元文件格式的接口
共166个文件
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2021-05-18
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SeuratDisk v0.0.0.9015 h5Seurat文件格式是专门为存储和分析多模式单细胞和空间分辨表达实验而设计的,例如,来自CITE-seq或10X Visium技术。 它保存所有分子信息和相关的元数据,包括(例如)最近邻图,降维信息,空间坐标和图像数据以及簇标签。 我们还支持h5Seurat和AnnData对象之间的快速磁盘转换,目的是增强Seurat和Scanpy之间的互操作性。 安装 SeuratDisk当前在CRAN上不可用。 您可以使用以下命令从安装它: if ( ! requireNamespace( " remotes " , quietly = TRUE )) { install.packages( " remotes " ) } remotes :: install_github( " mojaveazure/seurat-disk " ) 依存关
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seurat-disk:基于HDF5的单单元文件格式的接口 (166个子文件)
docsearch.css 11KB
pkgdown.css 7KB
bootstrap-toc.css 2KB
DESCRIPTION 2KB
.gitignore 288B
.gitignore 128B
h5Seurat-load.html 40KB
LICENSE-text.html 40KB
h5Seurat-spec.html 30KB
scdisk-class.html 24KB
h5Seurat-class.html 23KB
Convert.html 18KB
WriteH5Group.html 18KB
LoadH5Seurat.html 13KB
convert-anndata.html 13KB
H5ADToH5Seurat.html 13KB
GuessDType.html 13KB
AppendData.html 12KB
index.html 11KB
ReadH5.html 11KB
index.html 11KB
H5SeuratToH5AD.html 10KB
SparsePointers.html 10KB
ClosestVersion.html 10KB
GetObject.html 9KB
RegisterSCDisk.html 9KB
SaveH5Seurat.html 9KB
Transpose.html 9KB
SeuratDisk-package.html 9KB
BoolToInt.html 8KB
IsMatrixEmpty.html 8KB
UpdateKey.html 8KB
StringType.html 8KB
CompoundToGroup.html 8KB
WriteAttribute.html 8KB
h5Seurat-bindings.html 8KB
ChunkPoints.html 8KB
PB.html 8KB
AssembleObject.html 8KB
GetClass.html 8KB
GetMargin.html 7KB
Connect.html 7KB
TestH5.html 7KB
MakeSpace.html 7KB
PadNames.html 7KB
PadMatrix.html 7KB
IsSCDisk.html 7KB
WriteMode.html 7KB
H5Exists.html 7KB
RandomName.html 7KB
IsDType.html 7KB
h5SI.html 7KB
FileType.html 7KB
Dims.html 7KB
ImageWrite.html 7KB
BasicWrite.html 7KB
SparseWrite.html 7KB
Exists.html 7KB
H5Path.html 6KB
Writeable.html 6KB
GetParent.html 6KB
UpdateSlots.html 6KB
TestObject.html 6KB
Scalar.html 6KB
authors.html 5KB
index.html 5KB
404.html 5KB
bootstrap-toc.js 5KB
pkgdown.js 3KB
docsearch.js 2KB
LICENSE 34KB
README.md 4KB
NAMESPACE 4KB
.nojekyll 1B
Convert.R 45KB
zzz.R 25KB
WriteH5Group.R 19KB
h5Seurat.R 15KB
scdisk.R 14KB
ReadH5.R 12KB
loom.R 12KB
LoadLoom.R 11KB
AssembleObject.R 10KB
LoadH5Seurat.R 9KB
SaveLoom.R 7KB
AppendData.R 7KB
SaveH5Seurat.R 7KB
GetObject.R 7KB
Transpose.R 4KB
PadMatrix.R 4KB
TestH5.R 3KB
h5info.R 3KB
h5Seurat_bindings.R 3KB
sparse_matrix.R 1KB
Connect.R 1KB
TestObject.R 952B
loom_bindings.R 902B
.Rbuildignore 228B
loom-class.Rd 19KB
scdisk-class.Rd 18KB
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