spearman的matlab代码-sscClust:更简单的单细胞RNAseq数据聚类

spearman的matlab代码 集群 更简单的单细胞 RNAseq 数据聚类 (sscClust)，是一个实现多种功能的软件包，这些功能是单细胞 RNAseq 数据分析的基本程序，包括可变基因识别、降维、简化数据的聚类。 还提出了一些新的想法，例如使用 spearman 相关性将数据投影到特征空间，使可视化和聚类更有效，使用子采样和分类进行聚类，使处理数千个细胞的数据成为可能。 安装 当数据集变大时计算会变得很昂贵，所以我们强烈建议使用链接到优化的BLAS库的R，例如ATLAS、MKL等。对于windows用户，建议使用Microsoft R open，对于类Unix用户，请参考如何使用外部 BLAS 库编译 R。 包 sscVis 是必需的。 要安装此软件包，只需： install.packages("devtools") devtools::install_github("Japrin/sscVis") devtools::install_github("Japrin/sscClust") 例子 运行集群管道以使用所有数据进行集群： data("sce.Pollen") sce