没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
compare_dp_mechanisms:比较释放最重要的SNP的不同差分专用机制的性能
共26个文件
ipynb:10个
py:10个
txt:2个
需积分: 10 1 下载量 198 浏览量
2021-05-13
12:12:56
上传
评论
收藏 3.71MB ZIP 举报
温馨提示
介绍 此存储库中的代码比较了三种差分私有机制的性能:拉普拉斯机制,指数机制以及提出的方法。 用于演示的数据是由生成的模拟的全基因组关联研究数据。 在以下论文中,此存储库中的代码用于产生结果: “用于全基因组关联研究的可扩展的隐私保护数据共享方法。” Yu,F.S.Fienberg,S.Slavković,C.Uhler(2014)。 生物医学信息学杂志(即将出版)。 该文件可在和。 示例数据生成 使用以下选项生成示例案例/对照基因型数据( example/case_genotypes.dat和example/case_genotypes.dat ): 人口:CEU SNP的来源: Chrom9_Chrom13_snps.txt 疾病模型文件: AR_chrom9_chrom13_Nov09_additive1_MAF025.txt 模拟类型:案例/控制 案例数:1000 控
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
compare_dp_mechanisms-master.zip (26个子文件)
compare_dp_mechanisms-master
start_ipynb.sh 173B
LICENSE 1KB
example.tar.gz 3.6MB
Chrom9_Chrom13_snps.txt 98KB
README.md 3KB
notebooks
get_JS_results.ipynb 4KB
write_JS_distance.py 3KB
loc_sig.ipynb 3KB
get_distance_to_significance.py 6KB
get_laplace_results.ipynb 5KB
get_JS_results.py 2KB
compare_all_dp_mechanisms.ipynb 127KB
compare_all_dp_mechanisms.py 9KB
get_laplace_results.py 2KB
get_distance_to_significance.ipynb 10KB
write_JS_distance.ipynb 5KB
loc_sig.py 2KB
write_chisquare.py 2KB
raw_to_geno_table.py 3KB
utility_functions.py 3KB
utility_functions.ipynb 5KB
get_expo_results.py 2KB
raw_to_geno_table.ipynb 5KB
get_expo_results.ipynb 5KB
write_chisquare.ipynb 4KB
AR_chrom9_chrom13_Nov09_additive1_MAF025.txt 214B
共 26 条
- 1
资源评论
slaslady
- 粉丝: 37
- 资源: 4620
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功