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GRaPe - Gene Reaction Protein Builder-开源
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2021-05-13
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GRaPe-独立于平台的软件工具,用于构建整合的基因React蛋白(GRP)网络。 它为每个React生成动力学方程式,并输出SBML文档。 它还实现了两种参数估计方法。
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GRaPe - Gene Reaction Protein Builder-开源 (513个子文件)
NewModelJPanel.class 56KB
IntegrativeModel.class 37KB
Matrix.class 32KB
Matrix.class 29KB
Parser.class 28KB
MathMLExpression.class 18KB
KgmlHandler.class 14KB
ParserTokenManager.class 13KB
MathMLConvertorSAX.class 13KB
InfixExpression.class 12KB
SBMLLevel2Reader.class 11KB
MainGUI.class 11KB
LMA.class 11KB
StoichiometricMatrix.class 10KB
MathMLConvertor.class 9KB
SSGA.class 9KB
SymbolTable.class 9KB
ConservationRelationFinder.class 9KB
Model.class 9KB
JavaCharStream.class 8KB
Species.class 8KB
JEP.class 8KB
SBMLModelTests.class 7KB
CompartmentModelTests.class 7KB
Reaction.class 6KB
MyReaction.class 6KB
StoichiometryMainGUI.class 6KB
ModelGenerator.class 6KB
NewModelGUI.class 6KB
Unit.class 6KB
Model2SBMLConvertor.class 6KB
Node.class 5KB
LUDecomposition.class 5KB
ManipulateSBML.class 5KB
ODEModelTests.class 5KB
UnitModelTests.class 5KB
KineticLaw.class 5KB
IntegrativeModelList.class 5KB
Event.class 5KB
Compartment.class 5KB
XMLReader.class 5KB
XMLPrinter.class 5KB
GeneExpressionJPanel.class 5KB
ParserDumpVisitor.class 5KB
SimpleSteadyStateEstimator.class 4KB
ParseException.class 4KB
BranchModelTests.class 4KB
AssignmentModelTests.class 4KB
AlgebraicModelTests.class 4KB
ESplash.class 4KB
UnitDefinition.class 4KB
BoundaryModelTests.class 4KB
SBMLLevel2Document.class 4KB
LUDecomposition.class 4KB
ReadAndStoreDataFromFile.class 4KB
UniUniReactionFunction.class 4KB
BiBiRandomReactionFunction.class 4KB
EvaluatorVisitor.class 4KB
FunctionModelTests.class 4KB
BiUniOrderedReactionFunction.class 4KB
GeneExpression.class 4KB
UniBiReactionFunction.class 4KB
Parameter.class 3KB
StoichiometricMatrixFrame.class 3KB
BiBiRandomReactionFunction$BiBiRandomRevMichaelisMentenFunction.class 3KB
GrapeSplashScreen.class 3KB
EventModelTests.class 3KB
DelayModelTests.class 3KB
EventAssignment.class 3KB
Notes.class 3KB
StoichiometricMatrix$MyTableModel.class 3KB
SimpleNode.class 3KB
SBase.class 3KB
EnzymeOnlyJPanel.class 3KB
MainGUI$TabButton.class 3KB
TokenMgrError.class 3KB
SpeciesReference.class 3KB
SBML2ModelConvertor.class 3KB
NewModelJPanel$TabButton.class 3KB
Link.class 2KB
JJTParserState.class 2KB
Annotations.class 2KB
SBaseId.class 2KB
JAMAMatrix.class 2KB
BiUniOrderedReactionFunction$BiUniRevMichaelisMentenFunction.class 2KB
UniBiReactionFunction$UniBiOrderedRevMichaelisMentenFunction.class 2KB
ConservationRelationFinder$ConservationRelation.class 2KB
ReactionFunction.class 2KB
VariableRule.class 2KB
StartPageImagePanel.class 2KB
MySpecies.class 2KB
UniUniReactionFunction$RevMichaelisMentenAPFunction.class 2KB
LMAMultiDimFunction.class 2KB
Instance.class 2KB
ArrayConverter.class 2KB
MathMLExpression$MathMLHandler.class 2KB
Test_Gene_Expression_Module.class 2KB
SimpleSpeciesReference.class 2KB
Main.class 2KB
MathMLConvertorSAX$MyErrorHandler.class 2KB
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