AMBER分析工作流程
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关于
该存储库是一个用于使用AMBER MD分析的工作流程。
您将需要在系统中使用Python 3.x 。 此工作流程的不同组件也需要安装R。
当前, scripts/目录中的Residue_E_Decomp_openmp.f90是用于测试的空白文件。 您可以从下载实际的脚本。
基本目录是此工作流程的入口点。
analysis :包含analysis的输出。
config :配置文件。 .tsv文件应用于为工作流提供目录树的“映射”。
rules :包含snakemake的规则和所有必需的函数定义。
scripts :生成系统特定脚本的基本脚本。 您可以在此处修改特定的分析或图形渲染。 它们被编写为采用config/config.yaml文件中指定的东西的系统参数,这些参数对于给定项目是唯一的。
建议您在编辑这些文件时使用 IDE,并为
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