MMP-26的同源模建及S1′结合袋的结构特点 (2014年)

以基质金属蛋白酶-12(MMP-12)的晶体结构为模板,采用同源模建方法构建了基质金属蛋白酶-26(MMP-26)的三维结构,并阐明了其S1′结合袋的结构特点,MMP-26中His233残基插入S1′结合袋,限制了S1′结合袋的深度,符合中袋MMPs的特点,因此MMP-26属于中袋MMPs. 在此基础上,研究了抑制剂GM6001与MMP-26的相互作用模式,发现GM6001中异羟肟酸结构的羰基氧和羟基氧与催化锌离子发生双齿配位,符合异羟肟酸类MMPs抑制剂的配位特点.