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期权matlab代码-hippovol:沿纵轴自动分割MRI海马体积
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2021-05-26
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预算matlab代码人海马沿其纵轴的自动分割。 创建该代码是为了自动分割MRI海马T1-w图像。 通过手动或使用社区中可用的工具(例如Freesurfer(已测试)或FSL)从大脑分割海马图像。 我们正在升级代码,如果有快速要求,请通过以下方式与我联系: 加里科兹·莱尔玛·乌萨比加加(Garikoitz Lerma-Usabiaga): 尽管该工具开发的主要重点是海马,但它可以应用于任何C形细长结构,例如call体。 该代码已用于生成以下论文中的所有数据(如果使用此工具,请引用为): G. Lerma-Usabiaga,Iglesias,JE,Insausti,R.,Greve,D。和Paz-Alonso。 下午(2016)。 人海马沿其纵轴的自动分割。 人脑映射。 要求和安装: git克隆此存储库(或下载.zip文件)并将其添加到您的matlab路径中。 将$ FREESURFER_HOME / matlab添加到您的路径 下载geom3d()并将其添加到您的路径。 在默认版本中,此软件要求您具有“优化工具箱”。 如果没有,您可以免费安装L-BFGS-B(),并在设置中更改选项。 如
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hippovol-master.zip (34个子文件)
hippovol-master
.gitignore 1KB
hip_readM.m 3KB
hip_BeziernDivisions.m 3KB
hip_fitBezierToCloud_vGari.m 5KB
hip_BezierLandmarkInsausti.m 4KB
hip_AcquLandmarkInsausti.m 2KB
hip_AcquMNIInsausti.m 4KB
hip_PCAind.m 861B
hip_computeCostAndGrad.m 1KB
hip_InitMethod.m 6KB
hip_sum_hippo_subfieldsfs6.m 3KB
LICENSE 1KB
hip_computeBezierPoints.m 749B
hip_run.m 8KB
hip_fitBezierTgPlane.m 3KB
mkdirquiet.m 476B
hip_PCALandmarkInsausti.m 4KB
hip_sum_cc.m 1KB
README.md 6KB
parsave.m 415B
hip_Landmark_Koen2aseg.m 2KB
MRIfspec.m 3KB
hippovol.m 12KB
hip_PCAPERCInsausti.m 7KB
README.txt 6KB
load_mgh.m 7KB
hip_sum_hippo_subfields.m 3KB
hip_AcquPERCInsausti.m 2KB
hip_BezierPERCInsausti.m 4KB
hippovol
data_01
mats
nDivisions_Bezier_Acqu_417.mat 2KB
cc_BeziernDivisionsInsausti10_cc_Acqu_v01.csv 37B
MRIread2.m 9KB
hip_writeM.m 2KB
hip_PCAnDivisions.m 6KB
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