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matlab集成c代码-nextflow-example:一个玩具示例Nextflow管道,该管道在Docker容器中运行Rsc...
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2021-05-22
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Matlab集成的c代码下一个流 为什么要使用Nextflow? 更快的原型制作 Nextflow允许您通过简化许多不同的任务来编写计算管道。 您可以重用现有的脚本和工具,而无需学习新的语言或API即可开始使用它。 重现性 Nextflow支持Docker容器技术,并与GitHub代码共享平台集成,可让您编写独立的管道,管理版本并快速重现以前的任何配置。 可移植性 Nextflow在您的管道逻辑和执行层之间提供了一个抽象层,因此它可以在多个平台上执行而无需更改。 它为Kubernetes,Amazon AWS和Google Cloud平台提供了开箱即用的执行器。 统一并行 Nextflow基于数据流编程模型,该模型大大简化了编写复杂的分布式管道的过程。 并行化由进程的输入和输出声明隐式定义。 最终的应用程序本质上是并行的,可以透明地向上或向外扩展,而无需适应特定的平台体系结构。 连续检查点 管道执行过程中产生的所有中间结果都将自动跟踪。 这样,无论停止原因是什么,您都可以从上一个成功执行的步骤中恢复执行。 安装 可以在以下位置找到Nextflow文档。 特别是,“入门”部分为。 使用c
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nextflow-example-master.zip (7个子文件)
nextflow-example-master
.gitignore 40B
nextflow.config 218B
_config.yml 25B
scripts
stage1.R 655B
stage2.R 709B
README.md 5KB
pipeline.nf 712B
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