利用高效液相色谱法分析了长江口E5柱状沉积物中叶绿素a(chlorophyll a),岩藻黄素(fucoxanthin),叶黄素(lute-in),玉米黄素(zeaxanthin)等13种色素的变化,大部分色素从表层到底层呈现减小的趋势,表层色素的含量分布为低于检测限-21nmol/g OC;结合有机碳、粒度等参数对E5的物源分析表明E5的有机质主要来源于现场生产的贡献。同时在短尺度上对岩藻黄素和叶绿素a的分析表明,叶绿素a对径流量有良好的记录,而岩藻黄素则可以反映上层水体硅藻的种群数量的变化。