harmonyos2-batchbench:批处理台

和声2 BatchBench：单细胞RNA-seq批量校正方法的灵活比较 BatchBench 是一个模块化且灵活的管道，用于比较单细胞 RNA-seq 数据的批量校正方法。 它考虑八种流行的 scRNA-seq 数据方法以及一组下游分析来执行批量校正，以评估其性能，包括计算混合熵、聚类分析、标记基因和UMAP 嵌入生成。 出版： Ruben Chaazarra-Gil、Stijn van Dongen、Vladimir Yu Kiselev、Martin Hemberg，核酸研究，2021；gkab004， 运行 BatchBench 饼图通过 bash 脚本run_batchbench.sh运行。 在此脚本中，您可以指定用于运行管道的源目录 ( source_dir )，以及将保存 nextflow 执行报告的 nextflow 报告目录 ( report_dir )。 此外， -resume选项允许继续执行工作流。 输入 输入到Batchbench必然是类SingleCellExperiment的RDSř对象。 要启用完整功能，必须根据您自己的情况修改nextflow.confi