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dpcmatlab源代码-3DQuantitativeDPC:3D定量DPC
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2021-06-02
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dpc matlab源代码该存储库提供了 Matlab 和 Python 代码,这些代码使用 3D DPC 通过聚焦强度测量来实现 3D 折射率重建算法。 图像应使用 LED 阵列照明或其他可切换光源捕获,生成三个(或更多)半圆形(或半环形)图案。 3D 弱对象传递函数 (WOTF) 是根据源模式、瞳Kong函数和散焦步长计算的。 最后,在 3D 解卷积过程后求解 3D 折射率。 与 2D DPC 情况一样,实现了具有 Tikhonov 正则化的最小二乘算法。 或者,具有总变差 (TV) 正则化和非负约束的去卷积进一步减轻了基于对象先验知识的伪影。 如果硬件允许,可以使用 GPU 代码,这大大减少了计算时间。 在 Python 代码中,我们使用 ArrayFire 库 () 及其 Python 包装器 () 进行 GPU 处理实现。 **运行matlab_code文件夹下的“main_3ddpc.m”,或者打开python_code文件夹下的“main_3ddpc.ipynb”jupyter notebook。 **示例数据集可以下载 请引用为: [1] M. Chen、L. Tian
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3DQuantitativeDPC-master.zip (12个子文件)
3DQuantitativeDPC-master
matlab_code
3ddpc_functions
gen1DCoordinate.m 1KB
genTransferFunction3D.m 3KB
sourceCompute.m 1KB
optimize_SP1.m 3KB
prox_projection.m 2KB
convertScatteringPotentialToRI.m 1KB
prox_L1.m 2KB
main_3ddpc.m 14KB
LICENSE.txt 2KB
python_code
main_3ddpc.ipynb 934KB
algorithm_3ddpc.py 16KB
README.md 2KB
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