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matlab分时代码-app-analyzePRF:应用分析
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2021-05-21
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matlab分时代码 app-analyzePRF文档 该应用程序获取执行视网膜检体任务(bold.nii.gz)的单个受试者的时间序列fMRI数据,并从其对刺激的视觉React(stim.nii.gz)中导出体素方式的pRF(人口感受野)测量值) 使用 。 在该模型中,将静态,压缩非线性应用于拟合的PRF之前的建模BOLD响应,这与人类视觉皮层中的空间总和具有压缩性的发现一致。 分析视觉响应的体素(或灰度坐标),并从fMRI数据中提取每个灰度坐标的属性。 PRF测量包括灰度坐标的r ^ 2(解释了方差),感受野的极角(以度为单位),偏心率(以度为单位)和大小(以高斯为单位的std(以度为单位)),以及PRF的(通常是压缩的)指数。高斯常用于建模感受野的视觉响应对比度,描述pRF模型的增益以及平均信号强度。 [ 与fMRI粗体图像尺寸相同的蒙版(mask.nii.gz)可以传入(例如,V1)以指定要分析的体素。 否则,默认情况下将使用Freesurfer的白色和部分表面之间的皮质丝带(在指定的波瓣中,默认为枕骨)。 刺激stim.nii.gz必须与功能磁共振成像的时间维度(TR)匹配,
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app-analyzePRF-master.zip (93个子文件)
app-analyzePRF-master
main.m 852B
create_mask.sh 1KB
config.json.sample 444B
analyzePRFcomputesupergridseeds.m 5KB
globalRegress.m 1KB
split_fmri.py 535B
utilities
figureprep.m 771B
linspacepixels.m 451B
consolidatemat.m 2KB
loadexcept.m 1KB
projectionmatrix.m 854B
calcunitcoordinates.m 689B
zerodiv.m 2KB
reshape2D_undo.m 930B
posrect.m 162B
placematrix2.m 911B
tseriesinterp.m 4KB
loadbinary.m 5KB
printnice.m 3KB
identity.m 249B
nanreplace.m 922B
sizefull.m 359B
getfigurepos.m 555B
setrandstate.m 471B
isrowvector.m 308B
calccod.m 4KB
getcanonicalhrf.m 6KB
equalizematrixdimensions.m 874B
linspacefixeddiff.m 365B
makegaussian2d.m 2KB
fitnonlinearmodel_consolidate.m 2KB
setfigurepos.m 1KB
fitnonlinearmodel.m 25KB
splitmatrix.m 1KB
olsmatrix.m 2KB
choose.m 314B
subscript.m 2KB
chunkfun.m 806B
vflatten.m 181B
figurewrite.m 2KB
randomword.m 756B
mkdirquiet.m 383B
loadmulti.m 3KB
flatten.m 176B
calcposition.m 987B
constructpolynomialmatrix.m 1KB
drawrectangle.m 776B
saveexcept.m 738B
vectorlength.m 932B
cell2str.m 475B
reshape2D.m 557B
consolidatematdir.m 1015B
fitnonlinearmodel_helper.m 8KB
outputfcnsanitycheck.m 2KB
zeromean.m 724B
strsplitalt.m 775B
squish.m 523B
drawellipse.m 2KB
calccorrelation.m 4KB
conv2run.m 996B
chunking.m 973B
makedirid.m 877B
copymatrix.m 1KB
isint.m 371B
placematrix.m 1KB
unitlength.m 3KB
linspacecircular.m 385B
savebinary.m 918B
straightline.m 1KB
stripfile.m 1KB
catcell.m 522B
statusdots.m 683B
swap.m 150B
matchfiles.m 9KB
analyzePRF.m 26KB
compile.sh 766B
analyzePRFcomputeGLMdenoiseregressors.m 3KB
avg_images.m 606B
compiled
run_main.sh 872B
mccExcludedFiles.log 3KB
main 61.03MB
requiredMCRProducts.txt 18B
commit_ids.txt 691B
readme.txt 4KB
create_vtks.sh 830B
preprocess_fmri.sh 770B
preprocess.sh 2KB
main 1KB
combine_fmri.py 600B
.gitignore 42B
README.md 9KB
clean.sh 243B
getPRF.m 3KB
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