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matlab分时代码-BayespRF:用于SPM的贝叶斯pRF工具箱
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2021-05-21
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matlab分时代码BayespRF工具箱 BayespRF工具箱是一个框架,用于指定和比较种群接受域(pRF)的模型。 模型是概率性的,并使用变分贝叶斯算法进行估计。 该工具箱内置于Matlab中,并且取决于。 好处: 神经和神经血管/ BOLD参数是按每个体素(或感兴趣区域)估算的 可以估计任何刺激维度和具有任意数量参数的模型 估计参数的不确定性(方差)以及参数之间的协方差 表达竞争假设的模型可以基于其证据进行比较(使用自由能近似)。 缺点: 模型估算在计算上很昂贵(每个CPU内核每个体素> 100秒) 该工具箱是新的,仍在开发中。 因此,请尽情使用它,但请谨慎对待结果。 相应的论文可在以下网址获得: 内容 正在安装 下载BayespRF工具箱。 您可以克隆此存储库或。 将“工具箱”文件夹复制到您选择的计算机上的某个位置。 使用子文件夹将“工具箱”文件夹添加到您的Matlab路径。 运行示例数据集(视网膜局部映射) 入门的一个好方法是尝试使用示例数据集拟合pRF模型。 该工具箱包含一个名为example_3T的文件夹,其中包含用于自动下载和分析示例数据集的必要脚本。 数据集是通过3
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BayespRF-master.zip (36个子文件)
BayespRF-master
toolbox
spm_prf_find_voxel.m 1KB
spm_prf_summarise.m 3KB
spm_prf_fx.m 3KB
spm_prf_get_ppd.m 3KB
spm_prf_analyse.m 23KB
spm_prf_editor.m 14KB
spm_prf_plot_entropy.m 3KB
spm_prf_export_samsrf.m 4KB
spm_plot_quartiles.m 2KB
spm_prf_review.m 18KB
response_functions
spm_prf_fcn_template.m 5KB
spm_prf_fcn_gaussian_polar_ellipse.m 9KB
spm_prf_fcn_gaussian_polar_angled.m 9KB
spm_prf_fcn_gaussian_polar.m 9KB
spm_prf_fcn_DoG_polar.m 10KB
spm_prf_fcn_DoG_polar_angled.m 10KB
spm_prf_fcn_DoG_polar_ellipse.m 10KB
spm_prf_import_label.m 2KB
spm_prf_bpa_within_subject.m 2KB
spm_prf_gx.m 3KB
spm_prf_import_surface.m 5KB
freesurfer
Read_FreeSurfer.m 878B
Readme.txt 177B
fs_read_surf.m 5KB
fscol.m 815B
fs_fread3.m 402B
spm_prf_review_surface.m 8KB
example_3T
scripts
prepare_inputs_polar_samsrf.m 3KB
extract_timeseries_batch.mat 1KB
first_level_batch.mat 51KB
Run_first_level.m 5KB
Run_pRF_analysis.m 3KB
.gitignore 739B
README.md 14KB
.gitattributes 378B
LICENSE.txt 34KB
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