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matlab口罩识别代码-mZAP:更新用于ZMW/TIRF成像的roiProjection。工作正在进行中
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2021-06-12
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matlab口罩识别代码ZMW 分析平台 (ZAP) 这项工作正在定期开发中,尚未完成! 概述 Matlab 构建了一个分析平台和 GUI,用于使用零模式波导 (ZMW) 进行配体结合的单分子成像实验。 该存储库集成了我在威斯康星大学麦迪逊分校攻读博士学位期间编写的各种软件。 该平台的主要功能(将)包括: 图像蒙版创建者 创建阈值图像掩码以定位 TIFF 图像中的单分子 时间序列创建器 在一堆 TIFF 图像上的每个局部单分子处创建强度值的时间序列 时间序列理想化 集成了我最近发表的使用自上而下的机器学习对给定时间序列中的状态和转换进行无监督识别的文章。 也可以在以下位置找到 DISC: 分析 理想化时间序列的一般分析,包括停留时间分析、状态占用分析、漂白步骤分析,以及导出到 QuB 以进行更高级的隐马尔可夫建模。 致谢 如果没有威斯康星大学麦迪逊分校的 Baron Chanda 博士和 Randall H. Goldsmith 博士的支持,这个项目是不可能实现的。 我还要感谢 Marcel Goldschen-Ohm 博士和 Owen Rafferty 对早期代码的贡献。 我的论文工
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mZAP-master.zip (16个子文件)
mZAP-master
maskMaker
createMask.m 711B
createMaskManual.m 4KB
maskMaker.mlapp 127KB
roiProjection
loadTiffStack.m 3KB
projectionGUI.mlapp 196KB
findRoisInImageMask.m 2KB
projectROIs.m 11KB
manualShiftPixels.m 1KB
fmgaussfit.m 5KB
adjustPixels.m 593B
roi.m 542B
fitRoisTo2dGaussians.m 6KB
subtractBackground.m 784B
LICENSE 34KB
README.md 2KB
zap.m 4KB
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