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sommatlab代码-ShapeAnalysis:斐济插件,用于基于DFT的形状因子计算
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2021-05-26
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som matlab代码形状分析 斐济插件,用于基于DFT的形状因子计算。 在这里,您可以找到Python代码“ AutoRotate_v1.0.py”来执行VRML曲面(.wrl文件)的自动旋转。 该代码作为脚本在Blender 2.75a内部运行。 这里还包括一个Blender文件“ AutoRotate_v1.0.blend”,其中已经嵌入了Python脚本。 这项工作可在Kriegel等人的Cytometry A 2017中作为论文获得。 Python脚本为用户提供了两种不同的选择,以便在Blender中以2D方式自动创建单元表面。 如果用户希望专注于蜂窝表面的细节,建议使用“灯泡”选项为“开”的脚本。 当主要焦点位于单元的裸露轮廓上时,应将灯关闭。 该脚本能够在用户指定的文件夹结构中搜索某些关键字。 然后,脚本会使用Blender对文件夹结构中与关键字匹配的所有文件进行分析。 每个曲面在所有三个维度上居中,渲染并随机旋转6次(可在脚本内部更改)。 每次旋转后,将生成细胞表面的图像。 为了更好地理解脚本的工作原理,我们在2017年的Cytometric A中提供了带有和不带有光
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ShapeAnalysis-master.zip (21个子文件)
ShapeAnalysis-master
RestingCells_smallSubset.zip 891KB
MobileCells_summary_normalised.csv 40KB
SHADE_.java 10KB
SHADE_.jar 6KB
PhagocytosingCells_summary_normalised.csv 5KB
SHADE_.class 9KB
RestingCells_allSubsets_summary_normalised.csv 16KB
Trains_SOM_v1_0.m 4KB
AllCells_summary_normalised.csv 84KB
_config.yml 26B
GUI_Autorotate.py 17KB
trainedSOM.mat 41KB
README.md 2KB
InteractingCells_summary_normalised.csv 24KB
Results_RestingCells_smallSubset.zip 32KB
build.xml 864B
AutoRotate_v2.0.blend 505KB
trainSOM.m 3KB
AutoRotate_v1.0.py 8KB
trainSOM_JoVE2018.m 4KB
AutoRotate_v1.0.blend 508KB
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