数据融合matlab代码-Lineage-Mapper:世袭制图器斐济插件和MATLAB源代码

数据融合matlab代码血统映射器 欢迎使用Lineage Mapper，它是由美国国家标准技术研究所（NIST）盖瑟斯堡（GIST）的信息技术实验室，软件和系统部门开发的美国国家标准技术研究院的细胞跟踪应用程序。 我们开发了一种开源的，高度精确的，基于重叠的细胞跟踪系统，该系统可以跟踪一组延时图像中的活细胞。 谱系映射器的处理流程如图1所示。谱系映射器成功检测到动态单细胞行为：细胞迁移，细胞状态变化（有丝分裂，凋亡）； 集落内或整个集落内的细胞，细胞片内的细胞或细胞与细胞间的高度接触移动的细胞。 图1：沿袭Mapper处理管道和跟踪输出。 算法步骤包括：（1）从连续的帧中计算出细胞之间的成本，（2）检测细胞碰撞并解决它，（3）检测有丝分裂事件，（4）在细胞之间分配轨道，（5）创建跟踪输出。 输出包括保存的跟踪图像，细胞谱系图和4个跟踪输出测量值：（1）置信指数，（2）出生和死亡矩阵，（3）有丝分裂矩阵，（4）融合矩阵。 该存储库在一个分支中包含插件的源代码，在另一个分支中包含MATLAB原型的源代码。 快速导航 -- -- -- 样本数据集 我们有一个分割图像和跟踪结果的示例数据集。