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改变图像的对比度matlab代码-dcan-tensorflow:TensorFlow中的深度轮廓感知网络
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2021-05-26
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改变图像的静态matlab代码dcan-张量流 客观的 使用Chen等人创建的(DCAN)模型检测人U2OS细胞图像中的细胞核边界。 人注意:与纸张相比,上采样层没有辅助监控 图片集: 指示 tf-dcan/所有代码都是针对上述参考的Broad Institute人类U2OS细胞图像集编写的。 该图像集包含384个32个不同z索引(来自自动显微镜)的图像,尺寸为692 x 520。 要在自己的映像上运行,您必须: 如DCAN论文所述,生成一组地面真实轮廓和线段。 使用fm-prep/traceBounds.m作为起点。 根据您的数据(例如,图像尺寸,文件类型解码)在dcan-tensorflow/自定义bbbc006.py和bbbc006_input.py 。 要在U2OS映像集上运行代码,请遵循以下各节中的所有步骤。 前处理 fm-prep/目录包含MATLAB脚本,可自动为每个图像选择最佳焦平面。 将所有目录从U2OS映像集中移动到存储库的根目录。 在MATLAB中运行fmeasureAll()以计算每个图像的焦距。 确保将fmeasure的功能,改变线10 fmeasureAll
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dcan-tensorflow-master.zip (14个子文件)
dcan-tensorflow-master
.gitignore 83B
tf-dcan
bbbc006_train.py 5KB
bbbc006_eval.py 5KB
bbbc006_multi_gpu_train.py 11KB
requirements.txt 366B
bbbc006.py 18KB
bbbc006_input.py 7KB
README.md 3KB
fm-prep
fmArgmax.m 499B
getDirNames.m 157B
fmeasureAll.m 956B
saveImgs.m 441B
saveImgsAll.m 247B
traceBounds.m 823B
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