论文研究 - SAHA抑制锌的生物物理机制

所需积分/C币:6 2020-05-27 11:24:54 4.25MB PDF
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在产酸博德特氏菌中鉴定出的含锌酶HDAC样酰胺水解酶(FB188 HDAH)与参与表观遗传机制(例如组蛋白修饰)的酶相似。 FB188 HDAH与拮抗剂SAHA(suberoylanilide异羟肟酸)复合的X射线晶体结构已得到解决(PDB ID:1ZZ1)。 值得注意的是,络合物在晶体的不对称晶胞中结晶为四聚体。 该晶体产生合适的结构以分析SAHA对该组蛋白脱乙酰基酶的抑制机理的动力学。 应用计算化学技术和量子力学理论,计算了几种物理化学性质,以比较四种单体的酶的活性位点。 在结合袋的面积和体积以及疏水相互作用,偶极矩,原子电荷和静电势等方面观察到了显着差异。 值得注意的是,通过评估SAHA

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