对采集自云南省元谋等9个县的35个马铃薯和番茄晚疫病菌株用RAPD的方法进行了分子指纹的研究。马铃薯晚疫病菌和番茄晚疫病菌全基因组DNA指纹研究结果表明，两类晚疫病菌有丰富的遗传多态性，在不同的相似水平上可以划分为许多不同的遗传组群。来自不同寄主的菌株间有一定的遗传差异，但马铃薯晚疫病菌和番茄晚疫病菌不能完全划分为两个不同的组群，而是交叉分布在不同的遗传组群中。
### 马铃薯和番茄晚疫病菌全基因组DNA的RAPD多态性分析
#### 研究背景与目的
晚疫病是一种由致病疫霉（Phytophthora infestans）引起的植物病害，严重影响马铃薯和番茄的生长和产量。该病害在全球范围内都有分布，尤其是对于依赖这些作物作为主要食物来源的地区而言，其防控尤为重要。为了更好地了解晚疫病菌在不同地理区域和宿主间的遗传变异情况，本研究通过对云南省九个地区的马铃薯和番茄晚疫病菌进行随机扩增多态性DNA (Random Amplified Polymorphic DNA, RAPD) 分析，旨在揭示这些病原体的遗传多样性和群体结构。
#### RAPD技术简介
RAPD是一种无需知道靶序列信息即可进行DNA片段扩增的技术，通过使用短随机引物对基因组进行PCR扩增，从而产生一系列特异性的DNA条带。这些条带可用于构建样本间的遗传距离矩阵，并通过聚类分析来揭示样本间的亲缘关系及其遗传多样性。
#### 研究方法
本研究收集了来自云南省元谋等九个县的共35个晚疫病菌株，包括感染马铃薯和番茄的病原体。首先提取所有样本的全基因组DNA，并使用RAPD技术对其进行分子指纹分析。实验采用了多组随机引物进行PCR扩增，随后通过凝胶电泳分离扩增产物，并对比各菌株间的DNA条带模式，以此评估遗传多样性和群体结构。
#### 研究结果
1. **遗传多样性**：研究发现马铃薯晚疫病菌和番茄晚疫病菌均具有较高的遗传多样性。通过不同的相似水平聚类分析，这些菌株被划分到多个不同的遗传组群。
2. **遗传组群划分**：即使是在同一寄主的不同菌株之间也存在一定的遗传差异。这意味着即使是感染同一种作物的晚疫病菌也可能属于不同的遗传组群。
3. **交叉分布现象**：尽管来自不同寄主（马铃薯和番茄）的晚疫病菌存在遗传差异，但它们并不能完全划分为两个不同的组群，而是出现了交叉分布的现象，即部分马铃薯晚疫病菌和番茄晚疫病菌菌株被分到了相同的遗传组群中。
#### 讨论
1. **遗传多样性的意义**：高遗传多样性表明晚疫病菌能够快速适应环境变化，这对于其在不同地域和宿主间的传播至关重要。这也意味着在防控措施设计时需要考虑到病原体的遗传多样性。
2. **交叉分布的原因**：交叉分布可能是因为不同寄主之间的晚疫病菌存在基因流动，或者是由于地理隔离导致的自然选择压力不同所致。这一现象提示我们在制定防治策略时，需要综合考虑多种因素。
3. **研究的应用价值**：通过深入理解晚疫病菌的遗传多样性及群体结构，可以帮助科研人员开发更有效的防控措施，如培育抗病品种、合理使用化学农药等，以减少病害对农业生产的影响。
#### 结论
本研究表明，云南省内马铃薯和番茄晚疫病菌具有丰富的遗传多样性，并且这些菌株能够在不同的遗传组群中交叉分布。这为后续研究提供了宝贵的遗传资源，有助于进一步探索晚疫病菌的进化机制以及开发更为精准的防控策略。
