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matlab匹配滤波代码-uvp_qc:uvp_qc
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2021-05-24
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matlab匹配滤波代码UVP灯质量控制 UVP在水中拍摄的图像上对颗粒进行计数,我们最近发现,对于某些图像,这些数字比预期的要低,与相邻的图像相比大约减少了一半。 这被诊断为是由灯故障引起的,其中两个灯中只有一个灯照亮了水量,导致颗粒数量减少了一半左右。 该代码的目标是自动检测这些情况,进行标记,并更正zooprocess输出的文件,以将正确的数据导入EcoTaxa。 代码结构 0.get_uvpb_profiles.R列出并从Villefranche中的服务器读取所有配置文件。 1.subset_profiles_for_tests.R读取其中的一些代表不同级别的故障灯,并将它们存储在test_data.csv.gz以便可以将它们用作自动过滤故障灯的基准。 每个filter-***.R文件都实现了过滤功能,该功能以每个UVP帧中的对象数目的配置文件作为输入,并尝试检测此数目突然下降的情况。 一些过滤器也可以用python(可能还有MATLAB)实现,并以相同的方式使用。 当前,在独立的Jupyter笔记本中实现了基于分位数的简单过滤器的版本。 test_filter.R读取测试数据
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uvp_qc-master.zip (19个子文件)
uvp_qc-master
.gitignore 77B
test_plots
dynamic_quantile.png 683KB
shifted_quantile.png 686KB
hampel_like.png 792KB
filter-shifted_quantile.R 489B
filter-density_function.R 3KB
1.subset_profiles_for_tests.R 1KB
test_filter.R 2KB
app.R 8KB
uvp_qc.Rproj 258B
test_data.csv.gz 918KB
filter-hampel_like.R 907B
filter-shifted_quantile.ipynb 56KB
0.get_uvpb_profiles.R 2KB
README.md 3KB
filter-symmetric_anomaly.R 2KB
filter-shifted_quantile-MATLAB.ipynb 66KB
filter-moving_kmeans.R 2KB
filter-dynamic_quantile.R 686B
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