matlab分时代码-openmp_mass_action:通过OpenMP并行将大众行动SimBiology模型转换为可编译模...

matlab分时代码openmp_mass_action 该项目是用于MATLAB SimBiology质量作用模型的MATLAB到C转换器。 对于需要使用不同参数或初始条件反复进行仿真的模型，可以使用OpenMP并行运行。 它使用SUNDIALS CVODE Solver（）来解决从SimBiologyReact生成的ODE系统。 给定许多要模拟的条件（参数或初始条件）和足够的线程，对于某些类型的模型（尤其是在安德鲁的论文中），该项目生成的代码可以在绝对时间内胜过MATLAB的已编译sbiosimulate命令。 求解ODE的某些运算（包括Jacobian运算和预处理Jacobian求解器）已进行优化，以具有较小的存储足迹（对于大多数模型/处理器组合，通常在L2高速缓存中）。 关于代码生成/编译过程，有很多不好的事情。 我对所有这些命令感到抱歉，并希望有人最终能使整个过程成为一个漂亮的单行命令。 由于合同原因，我无法在这个项目上做更多的工作，但希望有人能从中受益。 如果您想接管维护，请与我联系。 关于代码条件的注意事项：应将此代码视为研究质量（这是一种礼貌的表达方式，仅表示不愿意发布