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高斯扩散模型matlab代码-confocal_fluorescence:来自扩散分子模拟的荧光共聚焦显微镜数据模拟
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2021-05-26
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高斯扩散模型matlab代码共聚焦显微镜荧光模拟 该程序模拟了穿过共焦焦点的扩散粒子的荧光发射。 到目前为止,焦点具有高斯形状。 该程序接受背景噪声,并假设光子的泊松发射检测模型。 荧光模拟程序 FSim_main.m 主程序是一个matlab脚本,其中包含主要参数和对模拟函数的初始调用。 该程序是为模拟在立方盒中扩散的颗粒的痕迹而编写的,但是可以很容易地将其重写为其他形状的模拟盒。 选择的一些参数是: 每分子每秒的光子计数 要分析的焦点大小 背景光子计数 如果使用负载颗粒,则荧光团分布的类型 FSim_compute_distribution_fluorphores.m 计算给定条件下每个粒子中荧光团的分布。 当使用的粒子数量少于所有可用数量时,该函数会在粒子之间随机选择,以在每次模拟中生成尽可能多的可变性。 使用的参数是: num_particles_exp是每个条件下的粒子数 required_number_part_exp是具有非零个荧光团的粒子数 distribution_fluo_poiss逻辑变量,用于判断是否为特定的荧光团分布 k_average_exp荧光团pwe条件
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confocal_fluorescence-main.zip (8个子文件)
confocal_fluorescence-main
FSim_fluorescence_simulation_from_traj.m 7KB
FSim_main.m 6KB
LICENSE 34KB
compute_save_brownian_trajectory.py 7KB
README.md 3KB
FSim_compute_distribution_fluorophores.m 5KB
FSim_name_variables_and_sim_para.m 3KB
FSim_set_data_for_simulation.m 11KB
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- WongFeiHung2021-11-11为什么有错误
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