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中文matlab加载代码-TPGLDA:通过lncRNA-疾病-基因三方图预测lncRNA与疾病之间的关联的新方法
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2021-05-22
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中文matlab加载代码TPGLDA 通过lncRNA-疾病-基因三方图预测lncRNA与疾病之间的关联的新方法 ======================= TPGLDA软件说明(版本1.0.0) 开发者:中国科学技术大学信息科学与技术学院健康信息学实验室的丁亮 要求 4GB内存 MATLAB R2015a或更高版本 相关数据信息需要首先载入三方图中 /data/known_lncRNA_disease_interaction.txt /data/known_gene_disease_interaction.txt 第一个文本文件known_lncRNA_disease_interaction.txt是疾病和lncRNA之间的已知二进制关联表。 第二个文本文件known_gene_disease_interaction.txt是一个表格,列出了基因与疾病之间的已知二进制关联。 运行TPGLDA以推断lncRNA与疾病之间的潜在关联 我们提供了有关lncRNA_疾病关联和基因疾病关联的实验验证数据。 为了在TPGLDA上分析这些数据以进一步推断lncRNA与疾病之间的潜在关联,您应该
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TPGLDA-master.zip (29个子文件)
TPGLDA-master
data
diseasesimilarity.txt 572KB
known_gene_disease_interaction.txt 492KB
known_lncRNA_disease_interaction.txt 40KB
lncRNA_115.txt 855B
disease_178.txt 4KB
lncRNAsimilarity.txt 231KB
LOOCV_TPGLDA
TPGLDA.m 2KB
diseasesimilarity.txt 572KB
LOOCV.m 987B
Sim_lnc.m 201B
README.md 219B
lncRNAsimilarity.txt 231KB
roc.m 350B
Sim_dis.m 292B
LICENSE 34KB
TPGLDA_R
man
TPGLDA.Rd 3KB
repmat.Rd 1KB
TPGLDA-package.Rd 1KB
NAMESPACE 31B
TPGLDA_LOOCV
TPGLDA_LOOCV.R 5KB
R
TPGLDA.R 2KB
DESCRIPTION 386B
README.md 6KB
Read-and-delete-me 420B
.gitignore 500B
TPGLDA_matlab
final prediction candidate pairs.xls 524KB
TPGLDA.m 3KB
README.md 6KB
README.md 6KB
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