个旧锡矿分布着大量的层状矽卡岩,顺层产出。该层状矽卡矿成分较为简单,主要由钙铝榴石、钙铁榴石、透辉石、透闪石、绿泥石组成,不具典型的接触交代矽卡岩的特征。研究结果表明,该矽卡岩不是侵人体与碳酸盐岩接触交代的产物,而是沉积-火山沉积岩经后期热液改造形成的层状矽卡岩。
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