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求整幅图像平均值的MATLAB代码-multicolor_cellID_for_calcium_recording:该项目将使用...
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2021-05-28
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求整幅图像某些的MATLAB代码用于钙记录的多色cellID NeuroPAL蠕虫使用3个荧光团和一个泛神经标记物来进行细胞分割和鉴定。 它们还允许使用钙指示剂来记录细胞活性。 此回购组合了来自多色记录的信息,以将细胞身份分配给钙记录中的神经元。 设置 所有代码都在MATLAB中,并已在2019b和2020a中进行了测试 安装Paninski Lab NeuroPAL软件。 请注意,它还有2个其他必需的软件包。 我建议将用于钙记录的Multicolor cellID,NeuroPAL代码和NeuroPAL代码依赖项放在一个文件夹中,然后将整个文件夹添加到您的MATLAB路径中。 下载此仓库并将其添加到您的MATLAB路径中 下载yamlmatlab并将其添加到您的MATLAB路径 经过测试的版本可在此处获得: 其他版本: sys_config_default.yaml包含软件的默认值。 如果要更改任何值,请不要编辑此文件。 而是创建sys_config.yaml ,您添加的任何值都将覆盖默认文件中的值或创建新字段。 如果您正在使用tigressdata,则默认文件应该没问题,如果您在其
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multicolor_cellID_for_calcium_recording-master.zip (21个子文件)
multicolor_cellID_for_calcium_recording-master
get_default_adjustment_file.m 996B
align_multicolor_to_calcium_imaging.m 11KB
update_assignment_labels.m 5KB
README_adjust_multicolor_image.md 2KB
get_default_neuropal_input.m 1KB
load_multicolor_from_dat.m 2KB
sys_config_default.yaml 1KB
create_multicolor_adjustment_file.m 3KB
align_color_channels.m 9KB
get_pointcloud_assignments.m 5KB
create_calcium_reference_mobile.mlapp 53KB
read_cell_locations.m 874B
.gitignore 54B
get_dat_dimensions.m 662B
create_calcium_reference.m 6KB
adjust_multicolor_image.mlapp 66KB
check_cell_assignment.mlapp 92KB
README.md 10KB
get_config.m 434B
load_calcium_from_dat.m 4KB
create_trimmed_multicolor_file.m 2KB
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weixin_38639747
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