matlab如何敲代码-mcadre:通过确定性React评估（mCADRE）评估代谢上下文相关性，以生成组织特异性代谢模型草案

matlab如何敲代码计算机辅助设计 该软件包包含我对Wang等人，2012 （1）中描述的方法的Matlab代码的实现。 该方法旨在进行通用的全局代谢重建（例如， Human Recon 1 ）加上组织特异性基因表达证据的集合，并为选定的组织或细胞类型生成特定于背景的模型草案。 1） 入门 所有代码均已在Matlab R2014a中进行了测试，但应与该软件的早期版本兼容（至少要追溯到2011-2012年）。 mcadre需要安装以下工具并将其添加到Matlab路径中： COBRA工具箱：可从此GitHub克隆 fastFVA （2） ：可下载 fastcc （2） ：可作为FASTCORE软件包的一部分下载 要运行mCADRE方法，只需克隆此存储库并将目录添加到Matlab路径即可。 脚本run_mcadre提供了有关如何调用主函数mcadre 。 运行mcadre的命令的结构如下： [PM, GM, C, NC, Z, model_C, pruneTime, cRes] = … mcadre(model, G, U, confidenceScores, salvageCheck,