本研究主要探讨了翼手目蹄蝠科蝙蝠线粒体DNA (mtDNA) 控制区的分子特征及其进化。控制区（CR）是哺乳动物线粒体基因组中的一个关键非编码区，它对mtDNA复制的启动与调控起着至关重要的作用。本研究首次对蹄蝠科中的三属蝙蝠进行了mtDNA控制区全序列的测序和分析，揭示了其结构和进化的分子特征。
在哺乳动物中，mtDNA控制区通常包含三个主要的结构域：延伸转录启动区（ETAS）、中央区（CD）和保守序列区（CSB）。ETAS区又进一步细分为ETAS1和ETAS2两个保守元件，它们在不同的物种中显示出不同的变异度。本研究发现，在三叶蹄蝠（Aselliscus stoliczkanus）和双色蹄蝠（Hipposideros bicolor）中检测到了长度分别为26bp和80bp的重复元件，这些长重复元件可形成稳定的二级结构，推测它们可能与控制区的功能密切相关。
中央区（CD）是控制区中另一个重要的结构域，它由一系列保守元件组成。本研究中，通过分析检测到了5个保守元件，分别用字母F、E、D、C和B表示。这些元件在不同的物种中的保守性有助于维持mtDNA复制和转录的稳定性。
保守序列区（CSB）是控制区中功能最为核心的区域，它含有多个保守元件，如CSB1、CSB2、CSB3和CSB1-like元件。CSB2是变异度最高的部分，这可能与CSB2区域在基因调控中承担的角色更为复杂有关。相对地，CSB3是最为保守的部分，变异度几乎为零，表明它在不同物种中承担了极其重要的功能，不容许任何变异。此外，在CSB区域中还发现了不同长度（6bp、8bp、16bp或20bp）的串联重复元件。这些重复序列在不同蹄蝠属之间的长度、碱基组成和拷贝数存在差异，这可能反映了不同物种特有的进化历程。
本研究的发现对于理解mtDNA控制区在不同物种中的进化机制具有重要意义。mtDNA控制区的变异度和重复序列的拷贝数差异可能会对mtDNA的复制效率和细胞的能量代谢产生影响。这些结果为研究线粒体遗传学、细胞生物学以及进化生物学提供了新的视角和数据。进一步的研究可能需要结合更多的物种和更多的mtDNA功能域的分析，以揭示线粒体控制区及其进化特征的全面图景。
关键词中的“分子生物学”强调了本研究的方法学基础；“蹄蝠”指出了研究对象；“控制区”和“保守元件”则指出了研究的特定基因组区域和其中的关键序列；“重复序列”则是研究中发现的重要遗传特征之一。中图分类号“Q78”进一步指明了本研究所属的科学领域是分子生物学。
