吉布斯采样matlab代码hdp
R
pkg用于分层Dirichlet过程
要安装,请首先确保已安装devtools软件包并且BioConductor信息库可用(运行setRepositories()
)。
下载所有丢失的依赖关系并构建渐近线可能需要几分钟。
devtools
::
install_github(
"
nicolaroberts/hdp
"
,
build_vignettes
=
TRUE
)
有关教程,请参见browseVignettes("hdp")
。
在MacOS和Linux上可以使用,但在Windows上可能无法安装。
R包可使用分层Dirichlet流程对分类计数数据进行建模。
包括初始化任何形状的HDP,执行后验分布的吉布斯采样以及分析输出的功能。
基本理论由Teh等人描述。
(等级Dirichlet流程,美国统计协会杂志,2006,101:476)。
该R包改编自Yee
Whye
Teh编写的开源MATLAB和C代码,可在此处获得
Copyright
(c)
2015
Genome
Research
Ltd.
Author:
Nicola
Roberts
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