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matlab余玄函数代码-ConMod:识别多个生物网络中的保守功能模块
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2021-05-25
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matlab余玄函数代码康莫德 该算法用于识别多个网络中的保守功能模块,如以下所述: 特征相关的多视图非负矩阵分解,用于识别多个生物网络中的保守功能模块。 王佩卓,高林,胡玉轩和李峰。 BMC生物信息学,2018,19(1):394。 该算法主要在Matlab 2015b中实现。 用法 输入格式 该代码将一系列网络作为输入。 这些网络必须存储在matlab中类型为cell的变量中。 每个网络可以由以下两种类型表示: 邻接矩阵 边缘列表,例如: 1 2 0.62 1 3 0.88 2 9 0.14 ... 这些代码用于生成综合数据集: syn_dataset_common.m :保守的模块具有相同的大小,并且对于一组给定的网络是通用的。 syn_dataset_overlap.m :保守的模块仅存在于一部分网络中,它们是跨不同网络的特定模块的重叠部分。 主要功能 ConMod.m :ConMod算法的实现。 function modulesfinal = ConMod(multiNetworks, N, K, lambda, xita, maxIter) % INPUT: % multi
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ConMod-master.zip (15个子文件)
ConMod-master
ConMod.m 1KB
setSimilarity.m 405B
evaluation.m 2KB
moduleNodesSelection.m 2KB
syn_dataset_overlap.m 3KB
multiViewNMF.m 3KB
main_run.m 2KB
SNMF.m 1016B
featureNets.m 3KB
significantModules.m 5KB
LICENSE 34KB
syn_dataset_common.m 3KB
README.md 3KB
SNMFforView.m 1KB
.gitattributes 66B
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