第 29 卷第 10 期 西 南 大 学 学 报 (自然科学版) 2007年10月
Vol畅29 No畅10 Journal of Southwest University (Natural Science Edition) Oct畅 2007
文章编号 :1673 9868(2007)10 0129 05
菜 心 ISSR‐PCR 反 应 体 系 的 优 化
①
孙雪梅
1 ,2
, 乔爱民
2
, 孙 敏
1
, 桂腾琴
1 ,2
1畅 西南大学 生命科学学院 ,重庆 400715 ;2畅 仲恺农业技术学院 农业与园林学院 ,广州 510225
摘要 :以菜心(B rassica cam
p
estris L畅 ssp畅 Chinensis Var畅 utilis Tssen畅 et Lee畅 )为材料 ,对影响 ISSR‐PCR 扩增结
果的因素如 Mg
2 +
、 T a
q
DNA 聚合酶 、dNTPs 、Primer 、模版 DNA 的浓度及引物退火温度 、延伸时间和循环次数进
行了探讨 ,确立了适合菜心 ISSR‐PCR 分析的最佳反应体系和 PCR 扩增参数 :在 25
μ
L 反应体系中含 10 × buffer
2畅5
μ
L ,2畅0 mmol/L Mg
2 +
,0畅 5 U T a
q
DNA 聚合酶 ,0畅 2 mmol/L dNTPs ,0畅5
μ
mol/L 引物 ,30 ng 模板 DNA .
PCR 扩增程序 :94 ℃ 预变性 3 min ;94 ℃ 变性 1 min ,49畅7 ~ 56 ℃ 退火(退火温度随引物不同而定)1 min ,72 ℃ 延
伸 45 s ,40 个循环 ;72 ℃ 延伸 5 min .
关 键 词 : 菜心 ;简单序列重复间区 (ISSR) ;反应体系
中图分类号 :
Q
789 文献标识码 : A
ISSR 是 Zietkiewicz 等
[1]
于 1994 年创建的基于 PCR 的一种新微卫星类分子标记 .ISSR 标记为显性标
记 ,符合孟德尔遗传规律 ,遗传多态性高 ,重复性好 ,实验操作简单 、快速 ,结合了 RAPD 标记技术和 SSR
标记技术的优点 .ISSR 技术现已广泛应用于大麦 、小麦 、水稻 、马铃薯等农作物的研究
[2 4]
.
菜心(B rassica cam
p
estris L畅 ssp畅 Chinensis Var畅 utilis Tssen畅 et Lee畅 ) ,又称菜薹 ,是十字花科芸薹
属芸薹种白菜亚种中以花薹为产品的变种 .本研究以菜心的基因组 DNA 为模板 ,探讨 ISSR‐PCR 反应体
系中各种因素对其扩增的影响 ,以期获得菜心 ISSR 反应的最佳体系 ,为菜心种质资源的科学利用和分子
标记辅助育种等方面提供可靠的技术支持 .
1 材料与方法
1畅1 材 料
菜心种子(由广东省农科院提供)在温水中浸泡 20 min 后 ,将其点播在培养皿中 (培养皿中垫有两层浸
湿的滤纸) ,放入培养箱中 27 ℃ 暗培养至长出 3 cm 高的黄化苗作为供试材料 .
1畅2 方 法
1畅2畅1 DNA 的提取
采用改良的 CTAB 法提取 DNA ,紫外分光光度计检测其质量和浓度 ,最后稀释标定为 20 ng/μL ,放
入 - 20 ℃ 冰箱里备用 .
1畅2畅2 ISSR 反应条件优化
试验流程参照沈金雄
[5]
的扩增反应体系 ,反应体系总体积为 25
μ
L .本试验用引物 AF77130 对 ISSR
反应的影响因素(Mg
2 +
,T a
q
DNA 聚合酶 ,dN TPs ,Primer ,模板 DNA 的浓度 ,退火温度 ,反应循环数 ,
①
收稿日期 : 2007 04 03
基金项目 : 广东省自然科学基金资助项目(B1010412) .
作者简介 : 孙雪梅(1981 ) ,女 ,四川广元人 ,硕士研究生 ,主要从事植物学与植物生物技术研究工作 .
通讯作者 :乔爱民 ,教授 ,硕士生导师 .