没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
数据融合matlab代码-pltfbsmotif:分段线性机器学习模型,用于基于基序的转录因子结合位点预测
共57个文件
m:55个
license:1个
md:1个
需积分: 12 0 下载量 130 浏览量
2021-05-22
12:03:11
上传
评论
收藏 55KB ZIP 举报
温馨提示
数据融合matlab代码pltbbsmotif 分段线性机器学习模型,用于基于基序的转录因子结合位点预测 该存储库包含用于分段线性数据融合模型的MATLAB代码,用于基于基元的转录因子结合位点预测。 该代码用于2010年发表的文章《全基因组范围内的组蛋白乙酰化数据》中的分析,可改善对哺乳动物转录因子结合位点的预测。 该项目中的MATLAB代码由Stephen Ramsey编写,除了六个贡献模块: PSWM_MotifLocator.m , BM_Scan.m , basepairs2num.m , readfastaseqs.m :哈里·Lähdesmäki(个人通信) readbar.m , writebar.m :Matti Nykter(个人交流) 非常感谢Lähdesmäki博士和Nykter博士对该项目的贡献。 要求 该软件需要Waltraud Huyer和Arnold Neumaier的MATLAB软件“分支和FIT稳定噪声优化”(SNOBFIT),该软件可从Universitat Wien免费下载(下载SNOBFIT)[]。 该软件还需要MATLAB Statistics
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
pltfbsmotif-master.zip (57个子文件)
pltfbsmotif-master
README.md 1KB
code
ExtendBedFileFeatures.m 74B
RankTransform.m 422B
ConstrainedOptSNOBFIT.m 3KB
SumExtendedFragmentFiles.m 548B
RescaleScanningBarFileQuantile.m 243B
MaskCopyBarFile.m 2KB
oppositestrand.m 615B
RunCompPerfScoreBestModel.m 3KB
PSWM_MotifLocator.m 3KB
CompareMatrixToBinding.m 2KB
BedToBarFile.m 2KB
SelectGenomeFraction.m 2KB
BinBarFile.m 3KB
ScanAllSequences.m 2KB
FixedWigToBarFile.m 1KB
readfastaseqs.m 937B
SplitSequenceByNs.m 636B
ComputePerformanceScore.m 4KB
PlotROCCurves.m 6KB
basepairs2num.m 895B
ConvertBedFiles.m 2KB
ConvertBarToWig.m 2KB
ScanSequenceForMatrix.m 782B
MakeGenomeRegionsBedFile.m 2KB
RescaleScanningBarFile.m 523B
PSWM_Scan.m 2KB
GetGenomeChromSizes.m 1KB
writebar.m 3KB
OptimizePredictionModel.m 5KB
FindChIPSeqPeaks.m 8KB
TestComputeScore.m 649B
BarToTSV.m 467B
IsAllowedChromosome.m 1KB
ReevaluateModelSaveResults.m 3KB
AvgFragCountFiles.m 2KB
ComputeAreaUnderROCCurve.m 4KB
CellToWriteBar.m 2KB
BedToBarFileLabeledRegions.m 1KB
MaskBarFile.m 4KB
AnnotatePolIIPeaks.m 6KB
AnalyzeGCContent.m 2KB
AddBarFiles.m 4KB
ReadMatrix.m 406B
ReadBackgroundModel.m 355B
TsvToBarFile.m 408B
ComputePredictionScore.m 2KB
BM_Scan.m 2KB
MaxBarFiles.m 1KB
SumBarFile.m 1KB
readbar.m 2KB
RescaleBarFile.m 273B
IntervalOverlap.m 284B
OptimizeAndValidateModel.m 11KB
CombineTracksIntoMatrix.m 1KB
EvaluateRandomModel.m 2KB
LICENSE 11KB
共 57 条
- 1
资源评论
weixin_38612437
- 粉丝: 5
- 资源: 906
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 用 Python 生成功能强大的二维码工具(支持自定义颜色与 Logo)
- 1200与台达变频器modbus rtu 485 通讯程序.zip
- 2-命令行下播放音乐bofang
- 16.神威药业自控程序一套.rar
- 1200开放式通讯.zip
- s71500+modbus-rtu通讯说明和例程,.zip
- 西门子1200与ABB机器人TCP 通信案例.zip
- 基于OpenCV的OCR
- Androidstudio4.2.2版本
- utlog.sqlite
- Androidstudio4.1.2
- excel导入进度条设计方案
- 帮助文档能够很好的支撑前端技术学习
- 基于WebRTC与WoT的智能医疗架构设计与应用
- 2025跨年源码 跨年烟花html源代码
- 基于js+html+css实现简单的中国农历新年倒计时代码分享给需要的同学
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功