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中值滤波代码matlab-TwoColorUnmixing:用于光谱分解的双色成像数据相关性分析的代码
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2021-05-27
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中值过滤代码matlab TwoColorUnmixing 用于光谱分解的双色成像数据相关性分析的代码 使用Matlab R2018b和Windows 10.0进行编码和测试,所需的工具箱:统计和机器学习工具箱 无需安装; 只需将Matlab的工作目录导航到该文件夹即可。 安装时间:1分钟预期的运行时间取决于所选的参数设置,在典型计算机上,每1000个shuffle实例> 1分钟。 该代码的目的是演示在描述jYCaMP的手稿中(图2e-g)生成样本相关的零分布的过程。 双色成像导致收集效率和串扰之间的折衷。 为了具有合理的收集效率,通常使用滤波器组,例如,在对GFP和RFP成像时,使用会导致发射器之间出现少量串扰(〜10%)的滤波器组是正常的。 像我们之前进行的数项研究一样,我们希望利用两个功能指标之间的相关性来检测突触前和突触后间隔的相互作用。 但是,要执行适当的统计检验,我们需要考虑渗漏对样品相关性的影响。 补偿渗漏的一种常见方法是线性解混,它适合于高斯分布的强度。 但是,在功能成像中,光子计数是泊松分布的,并且解混(泊松模型下的最小二乘或最大似然)会导致样本相关性出现偏差。
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TwoColorUnmixing-master.zip (4个子文件)
TwoColorUnmixing-master
LICENSE 34KB
simulateUnmixing.m 4KB
README.md 2KB
optionsGUI.m 4KB
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