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第
8
卷第
6
期
2009
年
12
月
江南大学学报(自然科学版)
Journal
of
Jiangnan
University(
Natural
Science
Edition)
基因表达式编程中性突变梳理分析
未明放
吴访升 王宏涛
2
Vo
1.
8
No.6
Dec.
2009
(1.江苏技术师范学院计算机科学与工程学院,江苏常州
213001
j
2.
陕西理工学院计算机科学
与技术系,陕西汉中
723003
)
摘
要:针咛基因表达式编程
(GEP)
的进化模型,其基因纽存在不被表达的中性区,研究了
GEP
中性区在进化中的作用,指出
GEP
基因存在中性区域,进化进程中必存在中性突变,分析了
GEP
的
基因表示的中性区域存在的特点;通过控制基因长度和基因数量技术,调控中性区的大小和数量,
讨论了
GEP
的中性区域对进化的作用
O
实验表明,
GEP
中性区域保持
50%
-
80%
,能保证较高的
挖掘成功率。
关键词:中性遗传;基因表达式编程;进化计算;中性突变
中图分类号
:TP
311
文献标识码
:A
文章编号:
1671 -
7147
(2009
)06
-
0694
-
05
Genetic
Neutrality
Analysis
and
Research
of
Gene
Expression
Programming
ZHU
Ming-fang
1
,
WU
Fang-sheng
1
, W
ANG
Hong-tao
2
(1.
School
of
Computer Science and Engineering , Jiangsu Teachers University
of
Technology ,
Changzhou
213001
,
China;
2.
Department
of
Computer Science and Technology , Shaanxi University
of
Technology , Hanzhong
723003
, China)
Abstract:
Gene
expression
programming
(GEP)
is a
genotype/phenotype
system
with
non-coding
regions
in
genome
where
possible
neutral
mutations
would
be
accumulated.
In
this
study
,
the
role
of
the
genetic
neutrality
in
GEP
was
analyzed.
The
main
c
∞
on
旧
tri
巾
ibu
川
t
川
neutral
areas
in
genome
of
GEP
,
and
analyzing
the
features
of
genetic
representation
in
GEP
j
(2)
Analyzing
the
role
of
genetic
neutrality
in
GEP
by
controlling
the
length
,
the
number
and
the
extent
of
non-coding
regions
j
(3)
The
experiments
show
that
the
success
rate
of
GEP
is
high
if
holding
50%
-
80%
redundancy
in
genome.
Key
words:
genetic
neutrality
,
gene
expression
programming
,
evolutionary
computation
,
neutral
mutation
日本学者木村资生根据分子生物学的研究资
料,提出了分子进化的中性学说
[1]
。该学说指出中
性突变是生物进化的主要动力;并认为,多数或绝
大多数基因突变都是中性的,中性突变不会发生自
收稿日期
:2009
-
07
- 21;
修订日期
:2009
-
09
-
30
。
然选择与适者生存的情况,对生物的生存和繁殖能
力没有影响,自然选择也就不起作用,中性突变在
种群中的保存、扩散和消失完全是随机的。在生物
进化研究中,越来越多的证据表明,功能上较不重
基金项目:江苏技术师范学院博士启动基金项目
(KYY0900
1)
0
作者简介:朱明放(1
970
-)
,男,陕西咸阳人,副教授,工学博士。主要从事数据库与知识工程等研究。
Email: mfzhu2009@jstu.edu.cn
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